Université Paris-Saclay GS Santé et médicaments
L'environnement immunitaire des cancers joue un rôle clé dans la progression de la maladie et la réponse au traitement, et la modulation des réponses immunitaires peut être une thérapie efficace contre le cancer. L'objectif du décryptage du microenvironnement tumoral (TME) est d'identifier les déterminants qui bloquent une réponse immunitaire efficace. Dans le foie, la diversité cellulaire et moléculaire du TME est complexe - cet organe étant le site d'un état de tolérance immunitaire physiologique - et mal comprise. Cela est dû à des facteurs exogènes ou endogènes, intra- ou extra-tumoraux, qui façonnent l'immunité hépatique. Le cancer étudié est le cholangiocarcinome intrahépatique (ICC), une tumeur agressive du foie, le plus souvent fatale à court terme (survie à 5 ans L'objectif général de la thèse est de découvrir les mécanismes moléculaires et cellulaires locaux dans le foie et à distance de la tumeur primaire qui façonnent le phénotype immunitaire tumoral de l'ICC (souvent caractérisé par un environnement immunosuppresseur et l'exclusion des cellules T) et empêche la réponse au traitement. Plus spécifiquement, le projet vise à disséquer l'écosystème tumoral immunitaire et microbien de l'ICC humain dans le site de la tumeur primaire et dans les sites métastatiques grâce à l'intégration de données multi-omiques à grande échelle (exome, RNA Seq, cytométrie, histopathologie, imagerie multiplexée) ainsi que d'annotations cliniques. Nous établirons une vue d'ensemble du remodelage structurel et fonctionnel des lésions primaires et secondaires, et étudierons l'impact des métastases ganglionnaires et des thérapies néo-adjuvantes administrées aux patients atteints d'ICC (chimiothérapies anticancéreuses conventionnelles, thérapies ciblées) dans l'établissement ou l'amélioration de l'immunotolérance tumorale à travers le remodelage de la contexture immunitaire.
Brièvement, le paysage immunitaire dans les lésions primaires et secondaires, l'organisation architecturale, les interactions cellule-cellule, l'état d'activation et la fonctionnalité seront déterminés par des techniques de biologie moléculaire et cellulaire (immunomarquage des tissus, séquençage du transcriptome du foie et des métastases - RNA-Seq -, niveaux d'expression de l'ARNm et des protéines et l'activation des protéines liées aux voies et aux gènes identifiés dans les analyses transcriptomiques croisées, métagénomique intestinale et tumorale), analyse de la structure tumorale et évaluation de l'immunité (évaluation de l'état fonctionnel des sous-populations de cellules immunitaires et stromales, y compris les marqueurs des cytokines immunorégulatrices Th1, Th2 et Th17 et les marqueurs de l'activation des cellules B et T (FOXP3, points de contrôle immunologiques) et l'activation des fibroblastes, l'expression des ensembles de chimiokines et des récepteurs de chimiokines. Les résultats seront comparés au phénotype immunitaire de la tumeur ICC et au degré de dissémination métastatique dans les ganglions lymphatiques. Ce travail devrait contribuer à l'identification de leviers et de cibles.
Début de la thèse : 01/10/2025
Funding category : Programme CSC - UPSaclay
Nous recherchons un étudiant sérieux, travailleur et curieux des sciences. Nous souhaitons travailler avec un jeune chercheur à l'esprit critique et ouvert, capable de réfléchir, de produire et d'interpréter des résultats expérimentaux solides et reproductibles et de construire ainsi le programme en relation étroite et amicale avec les chercheurs et les ingénieurs/techniciens de l'équipe et du laboratoire. L'intérêt de l'étudiant pour les domaines de l'oncologie, de la biologie des tumeurs, de l'immuno-oncologie et du microbiote intestinal serait un avantage. We are looking for a serious, hard-working student who is curious about science. We would like to work with a young researcher with a critical and open mind, capable of thinking, producing and interpreting solid and reproducible experimental results and thus building the program in close and friendly relationship with the researchers and engineers/technicians of the team and the laboratory. The student's interest in the fields of oncology, tumor biology, immuno-oncology and gut microbiota would be an advantage.
Number of offers available: 1
Company/Institute: Université Paris-Saclay GS Santé et médicaments
Country: France
City: Villejuif Cedex
#J-18808-Ljbffr